1.ภารกิจ มีหน้าที่พิจารณาเสนอความเห็น วางแผนอำนวยการ ประสานงาน กำกับดูแลเกี่ยวกับการขนส่งและเคลื่อนย้าย การขนส่งและเคลื่อนย้ายร่วม รวมทั้งการขนส่ง ทางทหารระหว่างประเทศ กำหนดความต้องการ และการปฏิบัติ ที่สำคัญตลอดจนพัฒนาหลักการที่เกี่ยวกับการขนส่งและ เคลื่อนย้าย เพื่อสนองความต้องการ ทางทหาร 

 2.การแบ่งมอบ เป็นหน่วยขึ้นตรงสำนักบริหารสิ่งอุปกรณ์

 3.การแบ่งส่วนราชการและหน้าที่ แบ่งส่วนราชการเป็น 3 แผนก คือ

 3.1 แผนกแผนขนส่งและเคลื่อนย้าย มีหน้าที่วางแผน อำนวยการ ประสานงาน และกำกับ ดูแลเกี่ยวกับ การขนส่งและเคลื่อนย้าย รวมทั้งแผนการขนส่ง ทางทหารระหว่างประเทศ ตลอดจนกำหนดหลักเกณ์การแบ่ง มอบทรัพยากร และการจัดลำดับความเร่งด่วน ในการขนส่งและเคลื่อนย้าย

 3.2 แผนกควบคุมมีหน้าที่อำนวยการประสานงาน กำกับดูแล และดำเนินการเกี่ยวกับ การขนส่ง และ เคลื่อนย้าย ของกองบัญชาการกองทัพไทย และเหล่าทัพ และร่วมมือกับส่วนราชการ รัฐวิสาหกิจ มิตรประเทศ องค์การหรือหน่วยงานต่างประเทศ ตลอดจนการยกเว้นภาษีและ พิธีการศุลกากร ในการจัดหา สิ่งอุปกรณ์ของ กองบัญชาการกองทัพไทยและเหล่าทัพ

 3.3 แผนกพัฒนามีหน้าที่ดำเนินการเกี่ยวกับการรวบรวมวิเคราะห์ประเมินค่า กระจายข่าวสารข้อมูล การขนส่งกำหนดและพัฒนาหลักการมาตรฐาน คู่มือ ระเบียบ และแนวทางปฏิบัตการขนส่งและเคลื่อนย้าย ของ กองบัญชาการกองทัพไทย รวมทั้งการพัฒนาแหล่งบริการขนส่งและสิ่งอำนวย ความสะดวกทางการขนส่ง